???jsp.display-item.social.title??? |
![]() ![]() |
Please use this identifier to cite or link to this item:
http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1054
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.creator | Leite, Franco Henrique Andrade | - |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/6921231386745339 | por |
dc.contributor.advisor1 | Taranto, Alex Gutterres | - |
dc.date.accessioned | 2020-04-24T22:49:02Z | - |
dc.date.issued | 2011-05-06 | - |
dc.identifier.citation | LEITE,Franco Henrique Andrade. Estudos de acoplamento molecular entre peróxidos obtidos de fontes naturais e o grupo heme. 2011. 130 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Biotecnologia)- Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, 2011. | por |
dc.identifier.uri | http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1054 | - |
dc.description.resumo | Artemisinina é uma lactona sesquiterpênica com um grupamento endoperóxido, a qual vem sendo usada contra cepas de Plasmodium falciparum resistentes ao tratamento com cloroquina. Os compostos endoperóxidos agem supostamente no grupo heme levando a redução da ligação peróxido e produção de radicais que podem matar o parasito. Estudos recentes mostraram que a artemisinina pode inibir a enzima ATPase cálcio-dependente (PfATP6) localizada no retículo sarco/endoplamático, ou seja, fora do vacúolo do parasito P. falciparum. Atualmente, a malária mata mais do que a AIDS e a crescente resistência adquirida pelo parasito aos fármacos atuais endossam a necessidade de novas alternativas terapêuticas. O presente estudo teve por objetivo geral identificar potenciais fármacos antimaláricos obtidos de fontes naturais e por objetivo específico correlacionar os estudos in silico com os estudos in vitro, no intuito de validar os estudos de Acoplamento Molecular. De posse deste conhecimento foi estudada a interação de 51 peróxidos com o grupo heme, comparando-os com os valores obtidos para a artemisinina. Estes peróxidos foram divididos em dois conjuntos. O primeiro conjunto, denominado de conjunto treino, foi composto de 10 derivados da artemisinina com atividade biológica conhecida. O segundo conjunto, denominado de conjunto teste, foi composto por 40 peróxidos presentes na natureza tendo como principal foco compostos oriundos da flora brasileira, para os quais a atividade antimalárica não foi determinada. Os estudos de Acoplamento Molecular foram realizados em três etapas. Na primeira etapa, um estudo de Acoplamento Molecular rígido entre a artemisinina, 10 análogos sintéticos e o grupo heme foi realizado com o auxílio do AutoDock Vina 1.0.2. Em seguida, o cálculo de single-point no vácuo e solvente implícito (PCM) seguido de otimizações de cada complexo foram realizados com o auxílio do Gaussian 09W, através do método PM6. Finalmente, as correlações entre os parâmetros energéticos e os dados experimentais (Concentração Inibitória (IC50) e/ou constante de dissociação (Kd)) foram realizadas para todos os compostos do conjunto treino. Os resultados da matriz de correlação apontam relação significativa (α=0,01) entre energia do complexo e Kd de -0,75 através do teste de Spearman (ρ). O mesmo protocolo computacional foi executado para o conjunto teste. Todos os peróxidos naturais estudados apresentaram Mapa de Potencial Eletrostático Molecular (MEP) similar à artemisinina, onde a densidade de carga negativa localiza-se sobre os oxigênios do grupamento peróxido. Os resultados de energia final obtido a nível semi-empírico PM6, apontou os compostos “5” e “24” como potenciais fármacos antimaláricos. Desta forma é possível identificar que existem compostos naturais com possível atividade antimalárica, no qual a ferramenta da modelagem molecular pode guiar na identificação de compostos bioativos e por conseguinte no desenvolvimento de novos fármacos. | por |
dc.description.abstract | Artemisinin is a sesquiterpene lactone with an endoperoxide function currently used against strains Plasmodium falciparum. Endoperoxides are supposed to act on heme leading to reduction of the peroxide bond and production of radicals that can kill the parasite. In addition, recent studies have shown that artemisinin can inhibit the sarco/endoplasmic reticulum Ca2+-ATPase (SERCA) orthologue (PfATP6) of P. falciparum in Xenopus oocytes. Nowadays, malaria kills more than AIDS and the increasing parasite resistance to current drugs endorses the search for new therapies. In this study was proposed the identification of potential antimalarial drugs obtained from natural sources by molecular modeling. The main goal is to identify potential antimalarial drugs from natural sources, as well as identify possible correlations between in silico studies and experimental data. Thus, were studied the interaction of 51 peroxide with heme, comparing them with the values obtained for artemisinin. These peroxides were divided into two sets. The first set, called training set was composed of 10 artemisinin derivatives with known biological activity. The second set, called test set was composed of 40 peroxides present in nature with the primary focus of the compounds from Brazilian flora, which antimalarial activity has not been evaluated. Docking studies were performed in three steps. Firstly, a docking between artemisinin, 10 synthetic analogs and heme was carried out with AutoDock Vina 1.0.2. Then, the calculation of single-point in vacuum and solvent phase (PCM) followed by each complex optimization was performed with Gaussian 09W using the PM6 method. Finally, the correlations between the energies and the experimental data (inhibitory concentration (IC50) and dissociation constant (Kd)) were performed for all compounds of the training set. The correlation results indicated any significant (α = 0.01) between complex energy and Kd, -0,75 using Spearman test. The same computational protocol was performed realized for the test set. All natural peroxides selected showed molecular electrostatic potential (MEP) map similar to artemisinin, where the density of negative charge is located on the oxygens of the peroxide grouping. The results of final energy obtained at semi-empirical PM6, showed the compound "5" and "24" as promising antimalarial drugs. Thus, it is possible to identify that there are natural compounds with possible antimalarial activity, in which the modeling tool can guide the molecular identification of bioactive compounds and therefore the development of new drugs. | eng |
dc.description.provenance | Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2020-04-24T22:49:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Franco_Henrique_Versao_Final.pdf: 3838542 bytes, checksum: 40fdc657bd10e45c077623732c4a9751 (MD5) | eng |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2020-04-24T22:49:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Franco_Henrique_Versao_Final.pdf: 3838542 bytes, checksum: 40fdc657bd10e45c077623732c4a9751 (MD5) Previous issue date: 2011-05-06 | eng |
dc.description.sponsorship | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB | por |
dc.format | application/pdf | * |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Estadual de Feira de Santana | por |
dc.publisher.department | DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.initials | UEFS | por |
dc.publisher.program | Mestrado Acadêmico em Biotecnologia | por |
dc.rights | Acesso Aberto | por |
dc.subject | Peróxidos | por |
dc.subject | Antimaláricos | por |
dc.subject | Artemisinina | por |
dc.subject | Peroxides | eng |
dc.subject | Antimalarials | eng |
dc.subject | Artemisinin | eng |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS BIOLOGICAS | por |
dc.title | Estudos de acoplamento molecular entre peróxidos obtidos de fontes naturais e o grupo heme | por |
dc.type | Dissertação | por |
Appears in Collections: | Coleção UEFS |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
Dissertacao_Franco_Henrique_Versao_Final.pdf | Arquivo em texto completo. | 3.75 MB | Adobe PDF | Download/Open Preview |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.