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http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1512
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
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dc.creator | Sousa, Marcos Morais de | - |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/1514993227261604 | por |
dc.contributor.advisor1 | Duarte, Ângelo Amancio | - |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/8821536792042504 | por |
dc.contributor.advisor-co1 | Santos, Washington Luis Conrado dos | - |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9255856779100547 | por |
dc.date.accessioned | 2023-08-10T12:33:03Z | - |
dc.date.issued | 2023-02-08 | - |
dc.identifier.citation | SOUSA, Marcos Morais de. Um método semiautomático para estimação de fibrose intersticial. 2023. 97 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, 2023. | por |
dc.identifier.uri | http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1512 | - |
dc.description.resumo | A estimativa do teor de fibrose no interstício, critério que pode apontar complicações imunológicas e infecciosas, que podem estar associadas a um processo de rejeição de um rim transplantado, é possível com o uso da Classificação de Banff, analisando lâminas de biópsias renais coradas com Corante Tricromo de Masson. A avaliação da Fibrose Intersticial é semi-quantitativa e ocasiona subjetividade, que pode ser excessiva, uma vez que o diagnóstico e a análise correta de imagens são uma tarefa complexa e altamente dependente da experiência dos patologistas que a realizam. Neste cenário de incertezas quanto às análises de imagens de biópsias renais, métodos automáticos para auxílio ao diagnóstico utilizando técnicas computacionais podem contribuir para um aumento da qualidade do diagnóstico médico. Considerando que a Classificação de Banff é um relevante critério para avaliação do paciente com doença renal crônica submetido a transplante renal, é importante encontrar formas de auxiliar na mitigação da subjetividade e na variabilidade intra e interexaminador na avaliação de indicadores usados nesta classificação, especialmente na determinação do grau de fibrose intersticial. Neste contexto, este trabalho apresenta um método computacional para estimação semiautomática de fibrose intersticial, a partir de imagens digitais de biópsias renais, sob a perspectiva da Classificação de Banff. Um dataset de 309 imagens foi anotado por 5 patologistas e os resultados comparados com as medições feitas pelo sistema desenvolvido. Os resultados apontaram pouca concordância na avaliação entre os médicos, além de grande variância quando estes realizaram duas medidas consecutivas de um mesmo conjunto de imagem. Já em relação à qualidade do sistema, o mesmo realizou a medição de forma invariável, porém sua precisão não pôde ser avaliada de forma definitiva, em virtude da variabilidade obtida na análise dos patologistas. Em decorrência do grau variável de reprodutibilidade e concordância apresentado pelos médicos patologistas, a avaliação do desempenho do método computacional não trouxe resultados conclusivos, uma vez que não foi encontrado um padrão-ouro na equipe médica. Ainda assim, este projeto construiu um modelo semi-automático de avaliação de fibrose intersticial que está disponibilizado como parte das funcionalidades do projeto PathoSpotter (https://pathospotter.bahia.fiocruz.br). O sistema pode ser usado como estimador do grau de fibrose intersticial de seções da lâmina de biópsia que sejam selecionadas pelo patologista, e pode ser futuramente ajustado a partir da obtenção de um dataset com anotações consistentes de fibrose intersticial. | por |
dc.description.abstract | The estimation of the fibrosis content in the interstitium, suggested that it may accompany immunological and infectious complications, which may be associated with a process of rejection of a transplanted kidney, is possible with the use of the Banff Classification, analyzing slides of renal biopsies stained with Dye Masson's Trichrome. The evaluation of Interstitial Fibrosis is semi-quantitative and causes subjectivity, which can be excessive, since the diagnosis and correct analysis of images is a complex task and highly dependent on the experience of the pathologists who perform it. In this scenario of reflection regarding the analysis of images of kidney biopsies, automatic methods to aid diagnosis using computational techniques can contribute to an increase in the quality of medical diagnosis. Considering that the Banff Classification is a relevant criterion for evaluating patients with chronic kidney disease modified by kidney transplantation, it is important to find ways to help mitigate subjectivity and intraand inter-examiner variability in the evaluation of indicators used in this classification, especially in the inherited degree of interstitial fibrosis. In this context, this work presents a computational method to search semi automatically for interstitial fibrosis, from digital images of renal biopsies, from the perspective of the Banff Classification. A dataset of 309 images was annotated by 5 pathologists and the results compared with the measurements made by the developed system. The results showed little agreement in the evaluation between the physicians, in addition to a large variance when they performed two consecutive measurements of the same image set. In relation to the quality of the system, it carried out the measurement invariably, but its precision could not be definitively evaluated, due to the variability obtained in the analysis of the pathologists. Due to the variable degree of reproducibility and agreement presented by the pathologists, it was not possible to assess the quality of the computational method, since a gold standard was not found in the medical team. Even so, this project built a semi-automatic model for evaluating interstitial fibrosis that is available as part of the functionality of the PathoSpotter project (https://pathospotter.bahia.fiocruz.br). The system can be used as an estimator of the degree of interstitial fibrosis in biopsy slide sections that are selected by the pathologist, and can be adjusted in the future by obtaining a dataset with consistent notes of interstitial fibrosis. | eng |
dc.description.provenance | Submitted by Amanda Ponce (aponce@uefs.br) on 2023-08-10T12:33:03Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcos_Morais_de_Sousa.pdf: 47558344 bytes, checksum: 7d181c0cdcd9efe7d5a7432bc2e4a076 (MD5) | eng |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2023-08-10T12:33:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Marcos_Morais_de_Sousa.pdf: 47558344 bytes, checksum: 7d181c0cdcd9efe7d5a7432bc2e4a076 (MD5) Previous issue date: 2023-02-08 | eng |
dc.description.sponsorship | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - FAPEB | por |
dc.format | application/pdf | * |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Estadual de Feira de Santana | por |
dc.publisher.department | DEPARTAMENTO DE TECNOLOGIA | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.initials | UEFS | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação | por |
dc.rights | Acesso Aberto | por |
dc.subject | Processamento de imagem | por |
dc.subject | Segmentação de cores | por |
dc.subject | Fibrose intersticial | por |
dc.subject | Patologia computacional | por |
dc.subject | Image processing | eng |
dc.subject | Core segmentation | eng |
dc.subject | Interstitial fibrosis | eng |
dc.subject | Computational pathology | eng |
dc.subject.cnpq | CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO | por |
dc.subject.cnpq | CIENCIA DA COMPUTACAO::METODOLOGIA E TECNICAS DA COMPUTACAO | por |
dc.subject.cnpq | MEDICINA::ANATOMIA PATOLOGICA E PATOLOGIA CLINICA | por |
dc.title | Um método semiautomático para estimação de fibrose intersticial | por |
dc.type | Dissertação | por |
Appears in Collections: | Coleção UEFS |
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File | Description | Size | Format | |
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Dissertacao_Marcos_Morais_de_Sousa.pdf | SOUSA2023_DISSERTAÇÃO_PPGCC | 46.44 MB | Adobe PDF | Download/Open Preview |
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