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???metadata.dc.type???: Dissertação
Title: Modelagem comparativa e triagem virtual hierárquica para identificação de moduladores das OBPs de Lutzomyia Longipalpis
???metadata.dc.creator???: Santana, Isis Bugia 
???metadata.dc.contributor.advisor1???: Santos Junior, Manoelito Coelho dos
???metadata.dc.description.resumo???: A Leishmaniose Visceral (LV) é a segunda doença vetorial mais importante do mundo, transmitida nas Américas por Lutzomyia longipalpis, o controle do vetor é indispensável à prevenção da doença. Mas como não é possível identificar onde ocorre a oviposição, o combate é direcionado aos insetos adultos, utilizando armadilhas impregnadas com atrativos químicos. Considerando que as Proteínas Ligadoras de Odor (OBPs) atuam no primeiro nível de seleção dos odores, este trabalho utilizou uma metodologia in silico para identificar potenciais moduladores químicos olfativos do vetor baseando-se na estrutura das OBPs e de ligantes conhecidos. Para isso, foram preditas as estruturas tridimensionais (3D) de OBPs de L. longipalpis por três métodos de modelagem comparativa. O melhor modelo, predito pelo I-Tasser, foi refinado por Dinâmica Molecular no Gromacs. Então, numa abordagem hierárquica da triagem virtual, os compostos naturais do ZINC12 mais próximos dos típicos ligantes de OBPs no espaço químico global, fornecido pelo ChemGPS-NP, foram avaliados e escalonados quanto à afinidade com o sítio ortostérico da OBP, pelo acoplamento molecular no DOCK6. Os compostos foram pontuados pelo Gridscore, em seguida, os cem melhores classificados foram submetidos à pontuação pelo Amberscore, que levou em conta a flexibilidade tanto da OBP como dos ligantes acoplados. As conformações de menor energia interagiram com um bolsão hidrofóbico através dos resíduos Met6, Ala9, Gly10, Glu11, Arg14, Met53, Leu74, Phe118, Phe119, Pro120; grupamentos amino formaram pontes salinas com a carboxila do Glu11. Além disso, os resíduos Phe119, Asn29 e Gln69 formaram ligações hidrogênio, sendo que, este último resíduo formou ligações-H aceptoras e doadoras.
Abstract: The Visceral Leishmaniasis (VL) is the second most important vector-borne disease in the world, transmitted in the Americas by Lutzomyia longipalpis, vector control is essential for the prevention of the disease. But since it is not possible to identify the oviposition sites, the fight is directed to adult insects, using traps impregnated with chemical attractants. Whereas the Odorant Binding Proteins (OBPs) act in the first level of odor selection, this work used in silico methodology to identify putative vector olfactory chemical modulators based on the structure of OBPs and known ligands. For this, tridimensional (3D) structure of L. longipalpis OBPs were predicted by three comparative modeling methods. The best model, predicted by I-Tasser, was refined by Molecular Dynamics on Gromacs. Then, in a hierarchical virtual screening approach, natural compounds of ZINC12 closer to the typical OBP ligands in global chemical space, provided by ChemGPS-NP, were evaluated and staggered concerning affinity with the orthosteric site from the OBP, by molecular docking on DOCK6. The compounds were scored by GRIDSCORE, then the 100 best classified were submitted to AMBERSCORE, which took into account the flexibility from both OBP and the docked ligands. The lowest energy conformations interacted with a hydrophobic pocket through residues Met6, Gly10, Glu11, Ala9 Arg14, Leu74, Met53, Phe118, Phe119, Pro120, amino groups and formed ionic interaction with carboxyl of Glu11, Furthermore, Phe119, Asn29 and Gln69 formed hydrogen bonds, this last formed donor and acceptor H-bonds.
Keywords: Leishmaniose
Lutzomyia Longipalpis
Ecologia química
Odorant-binding protein
Modelagem comparativa
Triagem virtual
Leishmaniasis
Chemical ecology
Odorant-binding protein
Comparative modeling
Virtual screening
???metadata.dc.subject.cnpq???: CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Language: por
???metadata.dc.publisher.country???: Brasil
Publisher: Universidade Estadual de Feira de Santana
???metadata.dc.publisher.initials???: UEFS
???metadata.dc.publisher.department???: DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
???metadata.dc.publisher.program???: Mestrado Acadêmico em Biotecnologia
Citation: SANTANA, Isis Bugia. Modelagem comparativa e triagem virtual hierárquica para identificação de moduladores das OBPs de Lutzomyia Longipalpis. 2016. 90 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Biotecnologia)- Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, 2016.
???metadata.dc.rights???: Acesso Aberto
URI: http://localhost:8080/tede/handle/tede/441
Issue Date: 11-Mar-2016
Appears in Collections:Coleção UEFS

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