@MASTERSTHESIS{ 2018:678866513,
 	title = {Caracterização molecular e estrutural de quitinases de Moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora},
 	year = {2018},
 	url = "http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/856",
 	abstract = "A quitina é considerada o segundo biopolímero mais importante da natureza. O acúmulo natural no meio ambiente é incompatível com sua produção ininterrupta, o que demonstra que existem mecanismos naturais responsáveis por sua degradação. As enzimas quitinolíticas encontradas em quase todos os tipos de seres vivos são alvo de grande interesse na biotecnologia porque permitem a degradação da quitina em derivados úteis para vários setores produtivos da economia, em destaque as de origem fúngica. Diante desse panorama, a caracterização molecular a partir de extração de RNA e amplificação do cDNA e a análise de estruturas 3D por modelagem comparativa de sequências de quitinases obtidas do genoma de Moniliophthora perciniosa (STAHEL) AIME & PHILLIPS-MORA foram direcionadas para este estudo. O fungo cultivado em meio WY durante 8-10 dias cresceu vigorosamente em condições em que o farelo de trigo estava bem triturado. Como a expressão da quitinase é crucial para o crescimento do fungo, esse meio foi considerado satisfatório para a extração de RNA. O método tradicional de Trizol foi mais favorável do que o uso de kits para extração de RNA. Para a detecção de expressão de quitinases de M. perniciosa a partir de amplificação de cDNA, encontramos fragmentos relacionados à região de amplificação específica determinada por sequências do genoma (16426) e usando o par de primers Chit_TEIX_F / Chit_TEIX_R. A partir de 14 sequencias de quitinases obtidas do genoma, todas apresentaram domínio catalítico detectado, uma das quais apresentou 49,48 % de identidade com o molde (3G6M). Uma análise estatística utilizando o gráfico RAMACHANDRAN mostrou que a sequência do melhor modelo gerado (997) possui 97,2% de resíduos em regiões favoráveis. Em 5 modelos foi possível identificar o sítio ativo, sua posição e os resíduos envolvidos na catálise. Os 5 modelos construídos a partir do alinhamento das sequências 15210, 1679, 4357, 5707 e 997 com seus respectivos moldes pelo MODELLER apresentaram uma estrutura clássica de barril alfa-beta contendo α-hélices e folhas-β. Após alinhamento sequencial, refinamento e Dinâmica Molecular, o modelo final (997) analisado pelo SWISS MODEL apresentou alta similaridade estrutural com seu respectivo molde. A partir dos modelos 3D das quitinases e o fragmento específico amplificado por PCR, o uso de primers específicos para os modelos gerados sequenciamento e clonagem são objetivos para trabalhos posteriores.",
 	publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana},
 	scholl = {Mestrado Acadêmico em Biotecnologia},
 	note = {DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS}
}