@PHDTHESIS{ 2011:1479385315,
 	title = {DNA e RNA polimerases do plasmídeo mitocondrial de moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora: caracterização, expressão, estudo de inibidores e filogenia molecular},
 	year = {2011},
 	url = "http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1139",
 	abstract = "Neste trabalho foram estudados aspectos moleculares e evolutivos das DNA (DPO) e RNA (RPO) polimerases codificadas pelo plasmídeo mitocondrial de M. perniciosa. Modelos tridimensionais dessas polimerases foram construídos, utilizando Modelagem por Homologia, seguida de uma simulação por Dinâmica Molecular de 3500 picossegundos. Com as estruturas 3D das enzimas modeladas e validadas, foi realizado um processo de triagem virtual de compostos químicos, utilizando os bancos de dados KEGG, ZINC e PubChem, seguido do Docking Molecular (Autodock Vina) e Dinâmica Molecular MM/PBSA. Então, foram selecionados complexos mais estáveis DPO-Entecavir e RPO-Rifampicina. O estudo da expressão relativa dos genes codificadores das DNA e RNA polimerases foi feito através de RT-qPCR, utilizando-se cDNA diferentes fases de desenvolvimento do M. perniciosa. Foi na fase de primórdio em que houve um aumento significativo na atividade desses genes, o que provavelmente está relacionado com um processo de defesa do fungo contra o T. cacao. A análise filogenética foi realizada utilizando-se sequências de DNA e proteína das DPO e RPO do plasmídeo de M. perniciosa e de polimerases de outros 12 plasmídeos fúngicos, além de sequências de polimerases virais. Foram realizadas análises de Máxima Verossimilhança e Bayesiana, apenas de sequências fúngicas e da combinação entre fungos e vírus. As topologias das árvores filogenéticas resultantes dessas análises corroboram as hipóteses de Transferência Horizontal de Genes (THG) entre polimerases fúngicas e virais, além de delimitar as relações evolutivas das DPO e RPO do plasmídeo de M. perniciosa.",
 	publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana},
 	scholl = {Doutorado Acadêmico em Biotecnologia},
 	note = {DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS}
}