@MASTERSTHESIS{ 2014:1313026410,
 	title = {Descoberta de novos inibidores para a UDP-N-Acetilglicosamina Pirofosforilase do Moniliophthora perniciosa por triagem virtual},
 	year = {2014},
 	url = "http://localhost:8080/tede/handle/tede/103",
 	abstract = "Pragas são responsáveis por elevadas perdas na produção de cacau no Brasil e no mundo, dentre elas a vassoura-de-bruxa (VB) é uma das mais importantes e destrutivas para o cacaueiro, chegando a causar perdas de até 95% da produção. Essa praga disseminou-se muito facilmente no estado da Bahia devido a condições ambientais que proporcionaram a propagação da VB, causada pelo fungo Moniliophthora perniciosa. Diversos compostos químicos vêm sendo testados com o objetivo de prevenir ou erradicar a VB, porém não foram obtidos bons resultados, portanto, o presente trabalho teve como principal objetivo realizar ensaios in silico, a fim de identificar inibidores da UDP-N-acetilglicosamina pirofosforilase (UNAcP) do M. perniciosa. Para tanto, foram empregados métodos computacionais na busca de novos inibidores para a UNAcP, onde foram realizadas diferentes etapas de busca e avaliação. A etapa inicial da triagem virtual consistiu na escolha da função de pontuação, assim, foram avaliadas as seguintes funções de pontuação: Broyden­Fletcher­Goldfarb­Shanno (BFGS) presente no AUTODOCK VINA 1.1.2; Grid Score e Grid Score+Hawkins GB/SA ambos presentes no DOCK 6.5 e o cálculo do escore de consenso. Os resultados foram analisados através do cálculo de Fator de Enriquecimento (FE), analise da curva ROC e sua respectiva Área Sobre a Curva (AUC). O Grid Score apresentou FE(5)=7,85. A análise da curva ROC permitiu observar que a função Grid Score consegue identificar quase 40% das moléculas ativas com menos de 10% do banco de dados (moléculas ativas e falso positivos), a análise da AUC demonstrou que o Grid Score tem maior exatidão (AUC=0,87). Assim os resultados da avaliação apontaram o Grid Score como melhor função de pontuação para esse sistema. Foi utilizado um banco de dados composto por moléculas oriundas de fontes naturais. Os dez melhores resultados da triagem virtual feita no DOCK6.5 foram submetidos à plataforma on line ChemGPS-NP, para o cálculo dos descritores químicos. Assim, as moléculas foram recategorizadas, baseando-se nos valores do Grid Score do DOCK6.5 e descritores químicos do ChemGPS-NP. Os resultados apontaram a molécula ZINC68592326 com a melhor pontuação, a análise das interações intermoleculares indica que está molécula apresenta interações hidrofóbicas com os resíduos Ala380, Gln113, Gli112, Gli381, Ser168, Arg383, Pro221 e ligação de hidrogênio do tipo aceptora com distância de 3,32Å com o resíduo Asn224. A triagem virtual em banco de dados de moléculas oriundas de produtos naturais permitiu a investigação com um universo de estruturas com características muito diversas. Foi possível obter moléculas com grande diversidade estrutural entre os primeiros do ranking, porém, foram encontradas também moléculas muito similares às moléculas de referência. A utilização de métodos quimiométricos, é considerada muito útil e permitem uma escolha sistemática e consistente das estruturas, principalmente por levar em consideração, descritores químicos e características moleculares, permitindo uma avaliação mais criteriosa.",
 	publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana},
 	scholl = {Mestrado Acadêmico em Biotecnologia},
 	note = {DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS}
}