@MASTERSTHESIS{ 2011:2099483368, title = {Estudo do mecanismo catal?tico da enzima pirofosforilase do fungo moniliophthora perniciosa por de m?todos QM/MM}, year = {2011}, url = "http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1058", abstract = "Em 1989 a cultura brasileira do cacau sofreu uma queda em sua produ??o, o que, em parte, pode ser explicada pelo surgimento e desenvolvimento do fungo Moniliophthora perniciosa, que ? respons?vel por uma praga conhecida como vassoura-de-bruxa do cacaueiro. Tal praga afeta as planta??es de cacau levando a grandes danos s?cio-econ?micos e, devido a isto, o Brasil passou a importar esta mat?ria prima. Na busca por um controle efetivo da vassoura-de-bruxa, a rota metab?lica que leva a s?ntese da quitina, principal constituinte da parede celular do fungo, foi analisada na perspectiva da sele??o de um alvo potencial para a inibi??o da sua s?ntese. O alvo selecionado na rota metab?lica foi a enzima pirofosforilase, a qual ? a respons?vel em catalizar a rea??o de forma??o do intermedi?rio UDP-N-acetilglicosamina. A inibi??o da forma??o de UDP-N-acetilglicosamina afetar? a forma??o de quitina e, consequentemente, a s?ntese da parede celular, indispens?vel ? sobreviv?ncia do fungo. O presente trabalho consiste em um estudo do mecanismo da rea??o catalisada pela pirofosforilase do M. perniciosa para a forma??o da UDP-N-acetilglicosamina, atrav?s de m?todos de qu?mica computacional. Foram empregados c?lculos de din?mica molecular (DM) e Mec?nica Quantica/Mec?nica Molecular (QM/MM) para desenvolver os estudos reacionais assumindo como mecanismo b?sico a substitui??o nucleof?lica bimolecular (SN2). Uma estrutura de transi??o com um ?tomo de f?sforo pentavalente foi elucidada, a qual realiza intera??es com os seguintes res?duos do s?tio catal?tico Gli-112, Gli-113, Arg-116, Lis-123 e Gli-225. Tais res?duos devem ser explorados para o planejamento racional de novos candidatos a inibidores da referida enzima. Foi realizado tamb?m um escaneamento da rea??o com a adi??o do c?tion divalente Mg+2 baseando-se na literatura quanto ? localiza??o do ponto de inser??o deste ?tomo no sistema. Esta simula??o produziu uma estrutura intermedi?ria com fosfato em car?ter dissociativo, o escaneamento n?o demonstrou redu??o da energia de ativa??es o que como hip?tese explicativa sugere-se um local inadequado para a adi??o do fosfato ou, em ultima an?lise, um mecanismo de cat?lise que n?o perpassa por SN2 na presen?a do c?tion de magn?sio.", publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana}, scholl = {Mestrado Acad?mico em Biotecnologia}, note = {DEPARTAMENTO DE CI?NCIAS BIOL?GICAS} }