@PHDTHESIS{ 2011:47141054,
 	title = {DNA e RNA polimerases do plasm?deo mitocondrial de moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora: caracteriza??o, express?o, estudo de inibidores e filogenia molecular},
 	year = {2011},
 	url = "http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1139",
 	abstract = "Neste trabalho foram estudados aspectos moleculares e evolutivos das DNA (DPO) e RNA (RPO) polimerases codificadas pelo plasm?deo mitocondrial de M. perniciosa. Modelos tridimensionais dessas polimerases foram constru?dos, utilizando Modelagem por Homologia, seguida de uma simula??o por Din?mica Molecular de 3500 picossegundos. Com as estruturas 3D das enzimas modeladas e validadas, foi realizado um processo de triagem virtual de compostos qu?micos, utilizando os bancos de dados KEGG, ZINC e PubChem, seguido do Docking Molecular (Autodock Vina) e Din?mica Molecular MM/PBSA. Ent?o, foram selecionados complexos mais est?veis DPO-Entecavir e RPO-Rifampicina. O estudo da express?o relativa dos genes codificadores das DNA e RNA polimerases foi feito atrav?s de RT-qPCR, utilizando-se cDNA diferentes fases de desenvolvimento do M. perniciosa. Foi na fase de prim?rdio em que houve um aumento significativo na atividade desses genes, o que provavelmente est? relacionado com um processo de defesa do fungo contra o T. cacao. A an?lise filogen?tica foi realizada utilizando-se sequ?ncias de DNA e prote?na das DPO e RPO do plasm?deo de M. perniciosa e de polimerases de outros 12 plasm?deos f?ngicos, al?m de sequ?ncias de polimerases virais. Foram realizadas an?lises de M?xima Verossimilhan?a e Bayesiana, apenas de sequ?ncias f?ngicas e da combina??o entre fungos e v?rus. As topologias das ?rvores filogen?ticas resultantes dessas an?lises corroboram as hip?teses de Transfer?ncia Horizontal de Genes (THG) entre polimerases f?ngicas e virais, al?m de delimitar as rela??es evolutivas das DPO e RPO do plasm?deo de M. perniciosa.",
 	publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana},
 	scholl = {Doutorado Acad?mico em Biotecnologia},
 	note = {DEPARTAMENTO DE CI?NCIAS BIOL?GICAS}
}